http://d.hatena.ne.jp/shohu33/20090321/1237701641
そこで、↑このurlに記載されている通り
show binary logs; -- で、現在あるログを確認し purge master logs to 'mysql-bin.000100'; -- で、ログ削除
で解消。
更にレプリケーションを使用しないのであれば、/etc/my.cnf の log-bin=mysql-bin の行をコメントアウトすることでログ出力を停止できます。
# Replication Master Server (default) # binary logging is required for replication #log-bin=mysql-bin ←ココ
参考までにlinuxのディスク容量が大きいデータ(ディレクトリ)を探すには、duコマンドで、以下の通り
# cd / # du -S | sort -n