http://www.ffmpeg.org/ffmpeg-doc.html
コマンドラインのオプションが多すぎますが、次のように動画からサムネイルを作成できました。
$ /usr/local/bin/ffmpeg -i input.flv -f image2 -an -y -vframes 1 -s 320x240 output.jpg
同様のことを次のurlで記載されていますが、perlのFFmpegは2006年以降、更新されていないようなので、perlで行う場合は、直接ffmpegを実行すると思います。
http://yusukebe.com/tech/archives/20061020/212715.html
http://search.cpan.org/perldoc?FFmpeg